Para abordar el reto de validar experimentalmente la función génica en organismos no modelos, como las tortugas, desarrollamos los primeros organoides de tortuga (Zdyrski et al., 2024) a partir del hígado de tres especies (Chrysemys picta, Chelydra serpentina, y Apalone spinifera) separadas por aproximadamente 175 millones de años de evolución, y en diversas etapas de su vida, lo que demuestra la amplia aplicabilidad de esta tecnología. Además, desarrollamos herramientas de edición, silenciamiento y sobreexpresión génica para la validación de genes candidatos en tortugas (en preparación). Estos organoides y herramientas de modificación génica representan un nuevo recurso genómico para la comunidad científica, que permiten estudiar el mapeo genoma-fenoma, la evolución genómica, lograr la diferenciación dirigida y anotar genomas con datos funcionales específicos de cada especie.
Este es un proyecto financiado por NSF IOS 2127995 - "EDGE FGT: desarrollo de fibroblastos y organoides como herramientas para genómica funcional en tortugas, aplicable a otros vertebrados".
Publicaciones
Zdyrski C, Vojtech G, Gessler TB, Ralston A, Sifuentes-Romero I, Kundu D, Honold, S, Wickham H, Topping N, Sahoo DK, Bista B, Tamplin J, Ospina O, Piñeyro P, Arriaga M, Galan JA, Meyerholz DK, Allenspach K, Mochel JP, and Valenzuela N. 2024. Establishment and Characterization of Turtle Liver Organoids Provides a Potential Model to Decode their Unique Adaptations. Communications Biology, 7 (1): 218. DOI 10.1038/s42003-024-05818-1.